Dados da SICO-eVM (plataforma de vigilância da mortalidade)
Extração, limpeza e organização dos dados do Sistema de Informação dos Certificados de Óbito – e-Vigilância de Mortalidade.
- Github Link
- julho 2020 - agosto 2020
- Entregue
Objetivos
Criação de um conjunto de ficheiros .csv e dicionários de dados com fontes que os voluntários considerem relevantes para estudos do impacto do COVID-19 na mortalidade em Portugal.
Equipa
Resultados
1 – Criar um script para extração de dados do portal SICO-eVM para dois ficheiros .csv, um com variáveis agrupadas por dd-mm-aaaa e outro por sem-aaaa;
2 – Criar um dicionário de dados (tabela em Markdown) com a descrição de cada variável;
3 – Criar um script para atualizar diariamente estes dados, com uma lógica semelhante ao que temos feito no repositório (usando o Github Actions);
4 – Criar um script de teste para testar a validade dos dados e o funcionamento do script, com os testes que considerarem relevantes;
5 – Incluir os scripts no workflow atual;
Mais detalhe no blogpost escrito pelos voluntários: https://www.dssg.pt/como-tornamos-os-dados-da-mortalidade-em-portugal-acessiveis-um-guia-passo-a-passo-contado-na-primeira-pessoa/